Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AknaQ80VW7 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms