Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Dsg1cQ7TSF0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms