Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ssx9Q6XAS3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Ssx9Q6XAS3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ssx9Q6XAS3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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