Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smchd1Q6P5D8 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms