Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Arhgap20Q6IFT4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap20Q6IFT4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms