Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gbf1Q6DFZ1 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gbf1Q6DFZ1 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gbf1Q6DFZ1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gbf1Q6DFZ1 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gbf1Q6DFZ1 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms