Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Sbno1Q689Z5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sbno1Q689Z5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms