Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tbr1Q64336 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tbr1Q64336 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tbr1Q64336 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Tbr1Q64336 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Tbr1Q64336 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tbr1Q64336 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
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Tbr1Q64336 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tbr1Q64336 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Tbr1Q64336 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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