Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc18Q640L5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Ccdc18Q640L5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc18Q640L5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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