Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kdm5dQ62240 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm5dQ62240 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms