Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

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Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sycp1Q62209 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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