Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SspnQ62147 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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