Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccne1Q61457 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccne1Q61457 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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