Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PcolceQ61398 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms