Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BcanQ61361 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BcanQ61361 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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