Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cln3Q61124 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cln3Q61124 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms