Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trim38Q5SZ99 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trim38Q5SZ99 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trim38Q5SZ99 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Trim38Q5SZ99 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Trim38Q5SZ99 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
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