Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rtl5Q5DTT4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rtl5Q5DTT4 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rtl5Q5DTT4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rtl5Q5DTT4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms