Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Fam220aQ3ZN08 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Fam220aQ3ZN08 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms