Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pydc3Q3V3Q4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms