Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms