Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shisa3Q3UPR0 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Shisa3Q3UPR0 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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