Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp30Q3UN04 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms