Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Hdgfl2Q3UMU9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Hdgfl2Q3UMU9 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Hdgfl2Q3UMU9 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms