Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx27Q3UHD6 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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