Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Fam117bQ3U3E2 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Fam117bQ3U3E2 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fam117bQ3U3E2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fam117bQ3U3E2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms