Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf40Q3U319 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rnf40Q3U319 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rnf40Q3U319 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rnf40Q3U319 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rnf40Q3U319 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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