Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Trappc9Q3U0M1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc9Q3U0M1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms