Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc13Q3TIR1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Trappc13Q3TIR1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms