Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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