Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc162pQ0VG85 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms