Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Itgb8Q0VBD0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms