Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 4933428M09Rik-201ENSMUST00000113046 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TrioQ0KL02 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms