Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Cdx4Q07424 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms