Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gjb5Q02739 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms