Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlh1Q02576 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms