Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ascl1Q02067 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms