Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VcpQ01853 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms