Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxd1Q01822 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms