Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Gjb2Q00977 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms