Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Serpina1cQ00896 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms