Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rbp4Q00724 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms