Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Itga4Q00651 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Itga4Q00651 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms