Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pkp1P97350 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pkp1P97350 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms