Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SbdsP70122 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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