Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Usp46P62069 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp46P62069 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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