Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lbx1P52955 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lbx1P52955 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lbx1P52955 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Lbx1P52955 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lbx1P52955 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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