Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fgd1P52734 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fgd1P52734 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms