Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cxcl5P50228 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cxcl5P50228 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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