Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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PtpreP49446 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PtpreP49446 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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